交警会在农村查电车违章，原因如下：
- 法律法规赋予权力：根据相关交通法规，交警的职责是对道路上行驶的车辆实施监督与指挥，农村的道路也属于其管理范围，无论是县道、乡道还是村道，交警都有权对在这些道路上行驶的电动车进行检查。
- 保障交通安全：随着农村电动车数量不断增加，一些安全问题逐渐显现，比如电动车质量良莠不齐，部分驾驶人交通安全意识淡薄，存在闯红灯、逆行、违法载人等行为，这些都给农村道路交通安全带来了隐患。为了减少交通事故，保障农民的生命财产安全，交警需要在农村开展电车违章检查工作。
- 推动合规管理：加强农村电动车管理，有助于推动农村车辆合规化。部分地区要求电动车上牌、驾驶人考取相应驾照等，交警通过查违章，可以督促农民遵守规定，办理相关手续，使电动车管理更加规范。
- 配合政策实施：各地政府为了加强交通管理，会出台一系列针对电动车的管理政策，交警在农村查电车违章是落实这些政策的具体行动，有助于政策的有效实施。
常见的农村电车违章情况有：无牌驾驶、违规载人、闯红灯、逆行、非法改装、人货混装等。