这需要根据所在城市的具体政策来判断：
- 北京：如果已经拥有一辆使用新能源指标登记的电车，那么不能再同时申请普通小客车配置指标和新能源小客车配置指标。若想更换车辆，只能申请新能源小客车更新指标。并且如果是以家庭为单位取得了新能源指标，按照家庭申请指标规则，所有家庭申请人十年内都不能再申请小客车指标。
- 深圳：已获得一个纯电动小汽车指标，名下无其他车辆，可以再申请普通小汽车摇号，即可以继续参与普通指标的排队。但如果名下有使用新能源指标登记的电车，同时又想申请新能源小汽车增量指标，按照《深圳市小汽车增量调控管理实施细则》，本市户籍人员、非本市户籍的内地居民等，持有效的准驾车型为C类或者以上的机动车驾驶证，并符合相关情形的，可以再申领一个混合动力小汽车增量指标或者纯电动小汽车增量指标。例如名下仅有1辆在本市登记的小汽车，且名下未持有有效指标以及不具有更新指标申请资格的等情况。
- 广州：新能源车无需摇号可直接申领指标。如果名下已有电车且是通过新能源指标登记的，在车辆更新时，也可按照相关规定申请新能源小客车更新指标。只要符合广州市对于新能源指标申请的条件，如住所地在本市，持有有效的机动车驾驶证，名下无应报废但未办理注销登记的机动车等，就可以继续申请新能源指标。
不同城市的小客车指标调控政策差异较大，建议查询所在城市的交通运输部门或相关机构发布的具体规定，以准确了解有电车后是否还能申请新能源指标。