日本电车卡可以充值，常见的充值方式如下：
- 实体卡充值
- 车站充值：在火车站或地铁站的自动售票机处，插入电车卡，在屏幕上选择“充值”或“加值”（チャージ）按钮，然后选择想要充值的金额，根据屏幕提示投入现金或使用信用卡进行支付，充值完成后机器会弹出卡片。出站前如果发现余额不足，也可使用精算机充值。
- 便利店充值：可以前往如7-11、Lawson等便利店，将卡片和现金交给店员，告知店员需要充值并说明充值金额，店员会帮忙完成充值操作。部分便利店也设有自助充值机，可按照界面指引自行充值。
- 电子卡充值
- 苹果设备：如果使用苹果手机或苹果手表，将电车卡添加到AppleWallet后，可以在钱包app中使用受支持的信用卡或储值卡进行充值。
- 安卓设备：部分电车卡推出了相应的手机应用，如“モバイル（mobile）icoca”app，安卓手机用户可在app设定后，直接使用、充值相应的电车卡。