宇通新能源电车主要使用磷酸铁锂电池和宁德时代 BC5 电池，部分燃料电池客车还会搭配磷酸铁锂电池作为辅助电源，具体如下：
- 磷酸铁锂电池：具有安全性高、循环寿命长等优点，适合作为新能源客车的动力电池。例如宇通 E12 纯电动城市客车采用磷酸铁锂离子动力蓄电池，电池容量 180kWh，续驶里程可达 250km，8 年电池衰减后不低于 70%，三万公里电池容量保持率在 90% 以上。
- 宁德时代 BC5 电池：宇通公交全系列产品已切换为宁德时代 BC5 电池。该电池具有更高能量密度，搭载在新能源公交车上的电池系统能量密度可达到 170Wh/kg，相较于现款电池 160Wh/kg 有明显提升；同时具有更长使用寿命，经过优化设计，具有较长的循环寿命，降低了更换频率和维护成本；还具有更强的环境适应性，能够在极端温度条件下保持高性能，适用于高温和严寒环境。
- 其他电池：在宇通的燃料电池客车上，如 ZK6125FCEVG2 公交车，以氢 - 空型质子交换膜燃料电池作为主要动力来源，同时搭配磷酸铁锂电池作为辅助电源，用于储存和提供车辆在启动、加速、制动等过程中的电能。
为适应不同的使用环境和工况，宇通客车的电池系统还配备了多种先进技术。例如，采用液冷电池系统并实现智能维护，防护等级达到 IP68 水平，有效提高系统稳定性，降低整车故障率，减少维护费用。在电池的安全管理方面，整车的电池采用氮气安全保护装置，能够使电池全天候工作在低氧环境下，保障电池安全。